L’apport de matière organique fraîche au travers d’effluents d’élevage, de couverts végétaux et de résidus de culture est souvent l’un des premiers leviers avancés.
Si les pratiques agricoles favorables à la matière organique du sol semblent bien identifiées, les mécanismes de sa création le sont beaucoup moins. Ils sont d’ailleurs nombreux, complexes et sans doute pas encore tous connus de la science. La vie du sol, la faune microscopique particulièrement, est au centre de ce jeu. Cependant, elle ne peut pas grand-chose sans ses carburants : le carbone et les différents nutriments indispensables à la création de la matière organique du sol.